GR団のキャッスル

GR団のキャッスルは、GR団のしまの施設。GR団の本拠地。

GR団のしまに到着した時点では向かうことができないが、闘のGR団のトリデを攻略すると入り口だけ入れるようになり、超のGR団コインと無のGR団コインを入手すると先に進めるようになる。超のGR団コインと無のGR団コインを入手した後にはじめて訪れると、敗北したランドが中から出てきて主人公に対戦を挑む。その後、GR団大かんぶのカンザキとルイと順番に対戦して勝利すると、GR団キングのビルリッチと2本先取のルールで対戦する。勝利するとGR団のミュウツーLV.35とGR団キングコインがもらえ、エンディングになる。エンディング後に再度ビルリッチに勝利するとふういんのトリデが解放される。

カードトレーナー

ルイは対戦するたびに使用するデッキと特別ルールがランダム（デッキとルールの組み合わせは固定）。

ビルリッチは対戦するたびに使用するデッキがランダム（ただし、マッチ戦中に使用したデッキは再度使わない）。

名前	使用デッキ	制限・特別ルール	サイド	パック	備考
ビルリッチ	いきのねとめろ! デッキ やきつくせ! デッキ たたきつぶせ! デッキ つまみだせ! デッキ	2本先取のマッチ戦	6	第7弾×2 （3回目以降）	GR団キング
ルイ	サイキックバトルデッキ	「抵抗力ていか」（抵抗力の効果がダメージ-10になる）	6	第5弾・第7弾	GR団大かんぶ
	ウルトラリムーブデッキ	「トラッシュブラックホール(BH)」 （トラッシュしたカードがゲームから除外される）
	ポイズンミストデッキ	「にげにくい場」（にげるときに必要なエネルギー+1）
カンザキ	わるいやつらデッキ	伝説のポケモンカード4種それぞれ1枚以上	6	第4弾・第6弾	GR団大かんぶ

備考

• 対戦条件を指定するトレーナーの大半が自身のデッキでも条件を守っているが、カンザキはデッキに伝説のポケモンカードを入れていない。同様の例としてグレースがいる。